商务港澳通行证的申请流程相对明确，但涉及多个步骤和材料准备，因此可以认为其流程具有一定的复杂性，申请流程大致包括以下几个步骤：
1、企业备案：
- 达到当地最低纳税标准，要求申请办理多次往来港澳商务签注的企业，首先要在企业所在地公安出入境管理部门申请备案。
- 提交《企业申办非公务<往来港澳通行证>登记审批表》和《申办非公务<往来港澳通行证>人员报备名单表》、企业营业执照、税务登记复印件（交验原件）、本企业上年度纳税证明或创汇证明等材料。
- 经公安出入境管理部门审查认定符合条件的，发给《企业申办非公务<往来港澳通行证>资格认定书》。
2、个人申请：
- 备案企业人员向企业所在地公安出入境管理部门提出申请，提交填写完整的《居民往来港澳地区申请审批表》、申请人近期正面免冠蓝底彩色光学照片、居民身份证、户口簿（交验原件）等材料。
- 已持有有效往来港澳通行证的，须提交通行证。
- 提交所在企业、经营单位出具的派遣申请人赴香港或澳门从事商务活动的派遣证明。
3、受理与审查：
- 受理机关收到申请材料后，进行初步核查，核对申请人是否符合申请条件、材料是否齐全等。
- 对符合条件的，予以受理并出具《受理回执》；不符合条件的，告知申请人需补正的全部内容并出具相关文书。
4、决定与制证：
- 根据审核情况作出是否签发证件和签注的决定。
- 制证部门制证，申请人可选择速递或到受理点领取证件。
关于需要的时间，整个申请过程通常需要一定的时间，具体取决于多个因素，包括材料的完整性、受理部门的工作效率以及是否需要额外的调查或核实等，如果材料齐全且符合要求，整个申请过程可能需要数个工作日到数周不等，具体的办理时间可能因地区和具体情况而有所不同。
商务港澳通行证的申请流程涉及多个步骤和材料的准备，因此具有一定的复杂性，建议申请人提前了解相关政策和流程，准备好所需材料，并按照要求逐步完成申请过程，也可以咨询当地的公安出入境管理部门以获取更详细和准确的信息。
