当基金公司倒闭后，处理投资者资产的程序和保障措施如下：
1、托管制度保障：公募基金的资金由独立第三方机构托管，通常是银行或证券公司，这种托管制度确保了基金财产的安全性和完整性，即便基金公司破产，资金依然受到保护。
2、清算程序启动：基金公司倒闭后，将按照《企业破产法》的相关规定进行破产清算，在清算过程中，基金财产不属于破产财产，不会被用于清偿基金公司的债务。
3、新管理人接管：如果基金公司倒闭，旗下管理的基金需要面临两种选择，一种是由达到清盘条件的基金按照清盘流程进行，清盘结束后拿回投资资金；另一种则是由证监会出面协调，让其他基金公司来并购或者接盘管理，实现基金管理的顺利过渡。
投资者应密切关注相关公告和信息，以便及时了解自己的权益状况并作出相应的决策。
