合作建房协议在签订时应注意多个法律问题，以确保协议的合法性和有效性，以下是一些关键要点：
1、合同主体适格性：
- 合作建房协议的主体一方必须是有偿取得土地使用权的主体，另一方必须是具有房地产开发经营资格的企业。
- 对于发包方，应了解其主体资格和履约能力，包括建设用地是否已批准、是否列入投资计划、规划和设计是否得到批准等。
- 对于承包方，应了解其资质情况、施工能力、社会信誉和财务情况。
2、明确性：
- 合同内容应包括当事人姓名或名称及住所、工程概况（如名称、地点、承包范围、质量标准等）、工程价款、工程验收方式、违约责任等约定的内容。
- 具体条款应详细规定双方的权利义务、资金筹集与管理方式、建设模式（如代建模式、联建模式、自建模式等）。
3、手续办理合规性：
- 合作建房各方必须共同办理立项手续、联建审批手续和土地使用权变更登记手续。
- 原为集体土地或划拨土地的，应办理法定的批准手续，联建各方以自己的名义在约定的比例范围内进行新建房屋的初始产权登记。
4、法律法规遵循性：
- 合同不得违反法律法规和公序良俗，否则可能被认定为无效。
- 特别要注意《土地管理法》关于农村宅基地的规定，确保宅基地使用权的合法性。
5、风险防范措施：
- 合同中应包含对可能出现的风险和纠纷的预防措施，如违约责任、争议解决方式等。
- 对于涉及大额资金的交易，建议委托专业律师进行尽职调查，确保交易的真实性和合法性。
6、合同效力认定：
- 依法成立的合同，自成立时生效；但法律另有规定的除外。
- 未经合法报建的合作建房协议，可能因违法而无效。
7、特殊情况处理：
- 对于涉及农村宅基地的合作建房，要特别注意宅基地使用权的转让限制和法律规定。
- 如果合作建房协议涉及虚假意思表示，则该协议无效。
信息仅供参考，在签订合作建房协议前，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保协议的合法性和有效性，并降低潜在的法律风险，由于法律法规和司法解释可能会随时间发生变化，因此在实际操作中应以最新法律法规为准。
