根据中国劳动法的相关规定，上班迟到一次扣50元作为处罚在某些情况下是被允许的，具体分析如下：
1、公司规章制度的合法性
规章制度公示：公司如果在规章制度中明确规定了迟到早退的处罚措施，并且这些规章制度已被公开公示并明确告知员工，则按照规章扣款通常是合法的。
合理性：规章制度应合理公正，不应过分严苛或超出员工正常承担范围，确保劳动者权益不受无理侵犯。
2、劳动合同的约定
：如果劳动合同中有明确条款允许在迟到情况下进行工资扣减，且符合法律规范，用人单位可以按合同执行。
合同变更：任何对劳动合同内容的修改都应经过劳动者的同意，不能单方面强行改变合同条款。
3、劳动法保护劳动者报酬权
工资保护：劳动法规定工资是劳动者为工作所应得的报酬，任何减扣工资的措施都需要有法律依据和合理的企业规定作为支撑。
最低工资标准：任何减扣工资的行为都不得违反当地最低工资标准。
4、违规操作的风险
不合理扣款：若没有合法的规章制度或劳动合同支持，因迟到扣工资可能被视为违法行为。
经济补偿责任：如果用人单位擅自扣罚工资，可能需要承担违法解除劳动合同的经济补偿责任。
在考虑上班迟到扣款的问题时，用人单位必须确保其行为与国家法律规定相符，遵循合理、公平的原则，作为员工，了解相关的法律知识同样重要，它能帮助劳动者在遇到类似问题时有效地维护自己的权益，在现代职场环境中，法律意识的提高对于建立和谐的劳资关系具有重要的促进作用。
