公务交通补贴个人所得税的处理方式是按照“工资、薪金”所得项目计征个人所得税，以下是对公务交通补贴个人所得税处理的详细介绍：
1、扣除标准：个人因公务用车和通讯制度改革而取得的公务用车、通讯补贴收入，在扣除一定标准的公务费用后，需按照“工资、薪金”所得项目计征个人所得税，按月发放的补贴并入当月“工资、薪金”所得计征个人所得税；不按月发放的，则分解到所属月份并与该月份“工资、薪金”所得合并后计征个人所得税。
2、公务费用扣除标准：公务费用的扣除标准由省级地方税务局根据纳税人公务交通、通讯费用的实际发生情况调查测算，报经省级人民政府批准后确定，并报国家税务总局备案，不同省份的扣除标准可能有所不同，山西省规定厅级每人每月1625元，处级每人每月1000元，科级及以下每人每月625元；广西壮族自治区对高级管理人员和其他人员分别设定了每月1950元和1200元的扣除标准。
3、特殊情况：对于实行公务用车制度改革的各级党政机关（包括党委、人大、政府、政协、审判、检察机关）等有关人员，按照规定取得的公务交通补贴在征收个人所得税时可扣除相应标准，超过标准的部分应并入工资薪金全额计征个人所得税。
4、申报注意事项：个人取得的公务交通补贴应并入工资薪金收入，扣缴义务人在预扣预缴个人所得税时需在《个人所得税扣缴申报表》填写到“其他扣除”项按不超过规定的标准据实税前扣除，并在备注栏注明“公务交通补贴”。
公务交通补贴个人所得税的处理涉及多个方面，需要纳税人和扣缴义务人充分了解相关政策规定，确保准确计算和申报个税。
